Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTPN1P18031 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPN1P18031 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPN1P18031 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms