Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PFKLP17858 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKLP17858 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKLP17858 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKLP17858 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKLP17858 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKLP17858 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PFKLP17858 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PFKLP17858 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PFKLP17858 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKLP17858 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKLP17858 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKLP17858 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PFKLP17858 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PFKLP17858 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PFKLP17858 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PFKLP17858 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PFKLP17858 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PFKLP17858 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFKLP17858 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PFKLP17858 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PFKLP17858 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKLP17858 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PFKLP17858 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms