Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMT2P17540 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CKMT2P17540 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CKMT2P17540 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms