Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXB9P17482 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXB9P17482 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXB9P17482 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXB9P17482 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXB9P17482 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXB9P17482 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms