Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EPCAMP16422 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EPCAMP16422 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms