Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTLA4P16410 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTLA4P16410 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms