Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GCFC2P16383 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GCFC2P16383 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GCFC2P16383 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms