Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB4P16144 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB4P16144 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms