Protein–RNA interactions for Protein: P15927

RPA2, Replication protein A 32 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA2P15927 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPA2P15927 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPA2P15927 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPA2P15927 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPA2P15927 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA2P15927 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA2P15927 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA2P15927 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPA2P15927 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPA2P15927 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RPA2P15927 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
RPA2P15927 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA2P15927 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA2P15927 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA2P15927 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
RPA2P15927 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
RPA2P15927 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms