Protein–RNA interactions for Protein: P15374

UCHL3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UCHL3P15374 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
UCHL3P15374 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
UCHL3P15374 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms