Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF2P15336 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF2P15336 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATF2P15336 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATF2P15336 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATF2P15336 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATF2P15336 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATF2P15336 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATF2P15336 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF2P15336 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF2P15336 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATF2P15336 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATF2P15336 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATF2P15336 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms