Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM27P14373 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM27P14373 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM27P14373 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms