Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRF1P14222 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRF1P14222 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRF1P14222 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PRF1P14222 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRF1P14222 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRF1P14222 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRF1P14222 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRF1P14222 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRF1P14222 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRF1P14222 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRF1P14222 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRF1P14222 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRF1P14222 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRF1P14222 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms