Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GTF2F2P13984 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GTF2F2P13984 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms