Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL6A2P12110 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL6A2P12110 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL6A2P12110 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COL6A2P12110 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
COL6A2P12110 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COL6A2P12110 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms