Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RALAP11233 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RALAP11233 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RALAP11233 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALAP11233 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALAP11233 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALAP11233 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALAP11233 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALAP11233 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALAP11233 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALAP11233 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALAP11233 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALAP11233 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALAP11233 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALAP11233 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALAP11233 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALAP11233 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALAP11233 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RALAP11233 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALAP11233 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALAP11233 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALAP11233 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALAP11233 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RALAP11233 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RALAP11233 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RALAP11233 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RALAP11233 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RALAP11233 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RALAP11233 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RALAP11233 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RALAP11233 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RALAP11233 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALAP11233 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALAP11233 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALAP11233 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALAP11233 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALAP11233 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALAP11233 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RALAP11233 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms