Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MCF2P10911 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2P10911 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2P10911 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2P10911 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2P10911 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MCF2P10911 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MCF2P10911 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2P10911 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2P10911 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2P10911 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2P10911 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2P10911 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MCF2P10911 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2P10911 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2P10911 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2P10911 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MCF2P10911 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2P10911 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2P10911 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2P10911 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MCF2P10911 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MCF2P10911 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MCF2P10911 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MCF2P10911 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms