Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
U2AF1L5P0DN76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
U2AF1L5P0DN76 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
U2AF1L5P0DN76 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
U2AF1L5P0DN76 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
U2AF1L5P0DN76 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms