Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C8orf88P0DMB2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
C8orf88P0DMB2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms