Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PGA3P0DJD8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PGA3P0DJD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms