Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC172P0C7W6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC172P0C7W6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms