Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CT47B1P0C2W7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CT47B1P0C2W7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CT47B1P0C2W7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms