Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
TNP1P09430 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
TNP1P09430 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms