Protein–RNA interactions for Protein: P09326

CD48, CD48 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD48P09326 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD48P09326 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD48P09326 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD48P09326 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD48P09326 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD48P09326 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD48P09326 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CD48P09326 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD48P09326 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD48P09326 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD48P09326 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CD48P09326 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD48P09326 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CD48P09326 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CD48P09326 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD48P09326 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD48P09326 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD48P09326 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD48P09326 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD48P09326 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD48P09326 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD48P09326 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms