Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
MMP10P09238 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MMP10P09238 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP10P09238 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP10P09238 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP10P09238 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP10P09238 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP10P09238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MMP10P09238 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MMP10P09238 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MMP10P09238 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP10P09238 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP10P09238 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP10P09238 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP10P09238 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP10P09238 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP10P09238 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP10P09238 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP10P09238 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP10P09238 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MMP10P09238 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP10P09238 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MMP10P09238 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MMP10P09238 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MMP10P09238 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MMP10P09238 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
MMP10P09238 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP10P09238 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP10P09238 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP10P09238 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP10P09238 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP10P09238 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP10P09238 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MMP10P09238 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP10P09238 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP10P09238 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP10P09238 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP10P09238 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP10P09238 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP10P09238 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms