Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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PKHD1P08F94 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKHD1P08F94 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKHD1P08F94 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKHD1P08F94 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PKHD1P08F94 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKHD1P08F94 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKHD1P08F94 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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PKHD1P08F94 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
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PKHD1P08F94 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PKHD1P08F94 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PKHD1P08F94 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PKHD1P08F94 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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PKHD1P08F94 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PKHD1P08F94 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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