Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT7P08729 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT7P08729 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT7P08729 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT7P08729 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT7P08729 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT7P08729 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT7P08729 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT7P08729 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT7P08729 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT7P08729 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT7P08729 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT7P08729 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms