Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NGFRP08138 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NGFRP08138 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NGFRP08138 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NGFRP08138 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NGFRP08138 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NGFRP08138 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NGFRP08138 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NGFRP08138 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NGFRP08138 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NGFRP08138 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NGFRP08138 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NGFRP08138 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NGFRP08138 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NGFRP08138 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NGFRP08138 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms