Protein–RNA interactions for Protein: P07954

FH, Fumarate hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHP07954 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FHP07954 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FHP07954 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FHP07954 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FHP07954 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FHP07954 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FHP07954 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FHP07954 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FHP07954 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FHP07954 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FHP07954 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms