Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TUBBP07437 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBBP07437 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TUBBP07437 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TUBBP07437 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TUBBP07437 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TUBBP07437 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TUBBP07437 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBBP07437 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBBP07437 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBBP07437 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBBP07437 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TUBBP07437 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBBP07437 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBBP07437 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBBP07437 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBBP07437 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBBP07437 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TUBBP07437 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TUBBP07437 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TUBBP07437 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TUBBP07437 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TUBBP07437 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms