Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
POLR3DP05423 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
POLR3DP05423 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms