Protein–RNA interactions for Protein: P02748

C9, Complement component C9, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P02748 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P02748 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P02748 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P02748 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C9P02748 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9P02748 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P02748 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C9P02748 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P02748 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P02748 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C9P02748 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C9P02748 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C9P02748 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C9P02748 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C9P02748 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P02748 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P02748 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P02748 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P02748 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P02748 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P02748 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C9P02748 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C9P02748 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C9P02748 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P02748 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P02748 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P02748 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P02748 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P02748 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P02748 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C9P02748 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms