Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC2P02655 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC2P02655 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC2P02655 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC2P02655 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC2P02655 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC2P02655 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
APOC2P02655 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
APOC2P02655 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
APOC2P02655 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
APOC2P02655 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
APOC2P02655 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
APOC2P02655 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC2P02655 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC2P02655 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC2P02655 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC2P02655 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC2P02655 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC2P02655 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
APOC2P02655 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOC2P02655 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms