Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CBX7O95931 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX7O95931 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CBX7O95931 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CBX7O95931 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX7O95931 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX7O95931 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX7O95931 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX7O95931 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX7O95931 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX7O95931 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CBX7O95931 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CBX7O95931 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX7O95931 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX7O95931 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX7O95931 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX7O95931 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CBX7O95931 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX7O95931 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX7O95931 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CBX7O95931 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX7O95931 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX7O95931 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX7O95931 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX7O95931 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CBX7O95931 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CBX7O95931 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CBX7O95931 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CBX7O95931 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CBX7O95931 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CBX7O95931 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms