Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN12O95859 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN12O95859 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms