Protein–RNA interactions for Protein: O95727

CRTAM, Cytotoxic and regulatory T-cell molecule, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAMO95727 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CRTAMO95727 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CRTAMO95727 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CRTAMO95727 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms