Protein–RNA interactions for Protein: O95455

TGDS, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGDSO95455 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGDSO95455 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGDSO95455 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGDSO95455 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGDSO95455 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TGDSO95455 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TGDSO95455 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TGDSO95455 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TGDSO95455 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TGDSO95455 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TGDSO95455 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGDSO95455 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGDSO95455 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TGDSO95455 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGDSO95455 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGDSO95455 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TGDSO95455 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TGDSO95455 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms