Protein–RNA interactions for Protein: O95171

SCEL, Sciellin, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCELO95171 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCELO95171 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCELO95171 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCELO95171 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCELO95171 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCELO95171 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCELO95171 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCELO95171 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCELO95171 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCELO95171 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCELO95171 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCELO95171 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCELO95171 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCELO95171 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCELO95171 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCELO95171 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SCELO95171 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SCELO95171 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms