Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM63AO94886 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM63AO94886 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms