Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A2O94788 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A2O94788 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ALDH1A2O94788 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms