Protein–RNA interactions for Protein: O76013

KRT36, Keratin, type I cuticular Ha6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT36O76013 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT36O76013 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT36O76013 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KRT36O76013 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KRT36O76013 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRT36O76013 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT36O76013 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT36O76013 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KRT36O76013 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRT36O76013 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KRT36O76013 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KRT36O76013 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KRT36O76013 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KRT36O76013 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms