Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRDM1O75626 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRDM1O75626 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PRDM1O75626 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms