Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E2F6O75461 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E2F6O75461 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E2F6O75461 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F6O75461 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F6O75461 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F6O75461 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E2F6O75461 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F6O75461 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F6O75461 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F6O75461 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E2F6O75461 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E2F6O75461 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F6O75461 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F6O75461 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F6O75461 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F6O75461 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
E2F6O75461 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
E2F6O75461 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
E2F6O75461 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
E2F6O75461 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms