Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NIPSNAP2O75323 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NIPSNAP2O75323 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms