Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PHACTR2O75167 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PHACTR2O75167 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHACTR2O75167 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms