Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF40O75150 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF40O75150 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF40O75150 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF40O75150 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF40O75150 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF40O75150 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF40O75150 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF40O75150 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF40O75150 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF40O75150 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF40O75150 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF40O75150 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF40O75150 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF40O75150 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RNF40O75150 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms