Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LRP4O75096 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LRP4O75096 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP4O75096 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP4O75096 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP4O75096 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LRP4O75096 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LRP4O75096 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRP4O75096 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRP4O75096 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRP4O75096 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP4O75096 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP4O75096 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP4O75096 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP4O75096 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRP4O75096 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP4O75096 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP4O75096 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRP4O75096 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
LRP4O75096 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LRP4O75096 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LRP4O75096 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms