Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTSVO60911 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTSVO60911 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSVO60911 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSVO60911 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSVO60911 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSVO60911 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSVO60911 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSVO60911 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CTSVO60911 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTSVO60911 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTSVO60911 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CTSVO60911 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTSVO60911 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTSVO60911 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSVO60911 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSVO60911 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSVO60911 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSVO60911 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSVO60911 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTSVO60911 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTSVO60911 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTSVO60911 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTSVO60911 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CTSVO60911 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms