Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF10O60809 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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PRAMEF10O60809 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF10O60809 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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