Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MSCO60682 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MSCO60682 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MSCO60682 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MSCO60682 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSCO60682 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MSCO60682 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSCO60682 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSCO60682 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MSCO60682 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSCO60682 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSCO60682 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSCO60682 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MSCO60682 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSCO60682 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSCO60682 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSCO60682 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSCO60682 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSCO60682 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSCO60682 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MSCO60682 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MSCO60682 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MSCO60682 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MSCO60682 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms